利用基因表達芯片探索多發(fā)性硬化的關(guān)鍵基因和通路
作者：黃帆; 唐玉蘭; 廖韋靜; 鄺慧敏; 藍嵐 廣西醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院老年神經(jīng)內(nèi)科; 廣西530021
摘要：目的以GEO數(shù)據(jù)庫中GSE21942系列芯片數(shù)據(jù)為分析對象,分析多發(fā)性硬化(MS)中的高通量基因表達來獲得差異表達的基因,篩選出與多發(fā)性硬化相關(guān)的關(guān)鍵基因和通路。方法利用R語言與DAVID、STRING等方法對差異表達的基因進行GO和KEGG富集分析,構(gòu)建和分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡。結(jié)果 88個基因被鑒定為差異表達的基因,其中76個基因(86.4%)上調(diào),12個基因(13.6%)下調(diào)。Pathway通路分析顯示,差異表達基因主要與造血細胞譜系、B細胞受體信號通路、破骨細胞分化、氮代謝等有關(guān),進一步分析篩選出ALAS2、CA1、SNCA、HBB、IL8等核心基因,這些基因在血紅素生物合成、突觸傳遞、神經(jīng)退行性疾病、血腦屏障破壞等生物功能中起重要作用。結(jié)論與健康人相比,多發(fā)性硬化樣本中相關(guān)靶基因表達有較大差異,這些數(shù)據(jù)可能為多發(fā)性硬化相關(guān)的發(fā)病機制和臨床治療提供新思路。
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安徽醫(yī)科大學學報雜志
安徽醫(yī)科大學學報雜志， 月刊，本刊重視學術(shù)導向，堅持科學性、學術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：基礎(chǔ)醫(yī)學研究、技術(shù)與方法、述綜等。于1955年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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