摘要：[目的]本研究旨在發(fā)掘水稻產(chǎn)量相關(guān)基因,為水稻產(chǎn)量性狀改良提供新的種質(zhì)資源,為水稻穗發(fā)育遺傳研究提供分子證據(jù)。[方法]利用表型差異明顯的粳稻‘茭白稻’和秈稻‘Saber’構(gòu)建F2群體,對其株高及穗部性狀進(jìn)行QTL檢測。根據(jù)F2結(jié)果,構(gòu)建F2∶3分離群體,對效應(yīng)值較高的穗長QTLqPL9進(jìn)行驗證、精細(xì)定位和候選基因預(yù)測,并對候選基因進(jìn)行克隆、測序和序列比對分析。[結(jié)果]在F2群體中檢測到株高、穗長、每穗穎花數(shù)、二次枝梗數(shù)、粒長和粒寬共6個性狀的16個QTL。其中效應(yīng)最高的qPL9解釋了32.8%的穗長變異,位于SSR標(biāo)記RM1189和L171之間,LOD值為8.27。對qPL9所在位點進(jìn)行驗證后進(jìn)行精細(xì)定位,最終將其定位在InDel標(biāo)記L174與L171之間,物理距離為90.47kb,含有9個開放閱讀框(ORF)。分析候選基因序列,發(fā)現(xiàn)LOC_Os09g28300、LOC_Os09g28310和LOC_Os09g28320的編碼序列在‘茭白稻’和‘Saber’間有差異,且導(dǎo)致氨基酸序列差異。[結(jié)論]qPL9是新位點,其候選基因可能為LOC_Os09g28300、LOC_Os09g28310和LOC_Os09g28320。