小桐子低溫脅迫下microRNA實時熒光定量PCR內(nèi)參的篩選與比較
作者：孔春艷; 陳永坤; 王莎莎; 郝大海; 楊宇; 龔明 云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 生物能源持續(xù)開發(fā)利用教育部工程研究中心; 云南省生物質(zhì)能與環(huán)境生物技術(shù)重點實驗室; 昆明650500
摘要：選擇合適的內(nèi)參對實時熒光定量PCR(qRT-PCR)結(jié)果的準確性極其重要,在microRNA(miRNA)的qRT-PCR分析中尤為如此。通過篩選適宜分析小桐子低溫脅迫下miRNA定量表達的內(nèi)參,為小桐子及其他物種miRNA的qRT-PCR分析提供有用的理論參考。基于以前的小RNA-seq結(jié)果,以低溫處理的小桐子為材料,挑選11個候選內(nèi)參基因,用實時熒光定量PCR技術(shù)檢測它們在不同樣本中的表達量,采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper軟件進行表達穩(wěn)定性綜合分析。結(jié)果表明,表達最穩(wěn)定的基因是miR6448和U6,miR6448的Ct值為23左右,表達豐度適中;U6的Ct值為10左右,表達豐度高;因此,miR6448可作為小桐子低溫脅迫下表達豐度適中的miRNA qRT-PCR的內(nèi)參基因;U6可作為小桐子低溫脅迫下豐度較高的miRNA qRT-PCR的內(nèi)參基因。
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生物技術(shù)通報雜志
生物技術(shù)通報雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：青貯微生物專題、研究報告、綜述與專論、技術(shù)與方法等。于1985年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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