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    小鼠后肢特異表達(dá)基因的篩選及驗證

    作者:王茂春; 段維旺; 李凱; 周宇荀; 肖君華 東華大學(xué)生物研究所; 上海201620

    摘要:目的對比小鼠前后肢基因表達(dá)譜的變化,篩選小鼠后肢特異表達(dá)的基因。方法通過NCBIGEO數(shù)據(jù)庫查找小鼠前后肢基因表達(dá)芯片,使用Transcriptome Analysis Console軟件對原始數(shù)據(jù)(5個前肢E10.5d芯片及4個后肢E10.5d芯片)進(jìn)行質(zhì)控,利用差異倍數(shù)為2倍以上或0.5倍以下及P值小于0.05進(jìn)行數(shù)據(jù)過濾,繪制差異表達(dá)基因的火山圖,并進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建后肢特異表達(dá)基因的相互作用分子網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果小鼠胚胎E10.5d后肢相較于前肢的差異表達(dá)的基因共有275個,其中上調(diào)的基因45個,下調(diào)的基因230個,構(gòu)建了后肢特異表達(dá)的差異基因分子網(wǎng)絡(luò)圖,找到后肢特異表達(dá)核心基因,使用qPCR檢測部分后肢特異表達(dá)的基因,結(jié)果與芯片結(jié)果一致。結(jié)論應(yīng)用小鼠表達(dá)譜芯片成功篩選出后肢特異表達(dá)的基因,為哺乳動物肢體發(fā)育的研究提供基礎(chǔ)。

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    中國實驗動物學(xué)報雜志

    中國實驗動物學(xué)報雜志, 雙月刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:研究報告、研究進(jìn)展等。于1993年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。

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