基于全基因組SNP的貴州久安古茶樹遺傳關(guān)系分析
作者：郭燕; 喬大河; 楊春; 李燕; 陳正武; 陳娟 貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所; 貴陽550006
摘要：貴州久安分布著大量的古茶樹資源。為了明晰這些茶樹資源間的遺傳關(guān)系,本研究以分布于久安5個不同區(qū)域的100份古茶樹為材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技術(shù)對它們的全基因組SNP進(jìn)行了鑒定,然后基于鑒定到的SNP進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建、主成分分析以及遺傳結(jié)構(gòu)分析。100份古茶樹材料共獲得548597個高質(zhì)量SNP,并對這些SNP進(jìn)行了變異類型注釋。系統(tǒng)進(jìn)化樹、主成分分析以及遺傳結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果高度一致,結(jié)果表明同一區(qū)域內(nèi)的材料間親緣關(guān)系較近;100份資源可以分為3個類群;古茶園(G)的材料與其他4個區(qū)域的材料遺傳背景差異較大,這4個區(qū)域的資源可能有相同的親本來源。
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植物遺傳資源學(xué)報雜志
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